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Illumina Infinity液相芯片實(shí)現(xiàn)千種甲基化位點(diǎn)并行檢測

更新時間:2025-09-15      點(diǎn)擊次數(shù):142

Infinity甲基化檢測系統(tǒng)采用新型亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化與分子索引技術(shù),實(shí)現(xiàn)單次檢測1,000個CpG位點(diǎn)的甲基化定量,檢測下限達(dá)1%。本文評估其多重PCR設(shè)計(jì)、UMI糾錯機(jī)制及在腫瘤早篩中的應(yīng)用價(jià)值。

關(guān)鍵詞:
DNA甲基化檢測 液相芯片 表觀遺傳學(xué) 腫瘤生物標(biāo)志物 微量樣本

性能指標(biāo):

  • 96樣本并行處理耗時<5小時

  • 甲基化定量與全基因組bisulfite測序相關(guān)性r=0.98

  • 僅需1ng輸入DNA

  • 批次間變異系數(shù)<5%

第四代DRAGEN平臺通過FPGA硬件加速與改進(jìn)壓縮算法,將30X WGS數(shù)據(jù)分析時間縮短至3分鐘,準(zhǔn)確率提升至99.95%。本文解析其新算法架構(gòu)、變異檢測優(yōu)化及臨床診斷集成方案。

關(guān)鍵詞:
DRAGEN 硬件加速 二級分析 變異檢測 臨床生物信息學(xué)

架構(gòu)革新:

  • 新型Smith-Waterman算法硬件實(shí)現(xiàn)

  • 結(jié)構(gòu)變異檢測靈敏度達(dá)99.1%

  • 支持SNV/Indel/CNV/SV同步檢測

  • 符合CAP/CLIA認(rèn)證標(biāo)準(zhǔn)



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